Η Σοφία Αφράτη εγκατέλειψε τα εγκόσμια, σε ηλικία 68 ετών. Ο θάνατός της προκάλεσε θλίψη στα παιδιά της Νίκο και Μαρία, Έλλη και Κώστα, στα εγγόνια, στα αδέλφια της, καθώς και στους υπόλοιπους συγγενείς της οικογένειας.

Η κηδεία της τελέστηκε το μεσημέρι του Σαββάτου 3 Ιουλίου, στον ιερό ναό Αναστάσεως του Λαζάρου, στο νέο Κοιμητήριο της Χαλκίδας, στο Πέι Δοκού.