Σε ηλικία 78 ετών άφησε την τελευταία του πνοή ο Γιάννης Βαρθαλής. Ο θάνατός του βύθισε στη θλίψη την σύζυγό του Βασιλική, τα παιδιά του Ελένη και Αντώνη, Δήμητρα, Ειρήνη και Γιώργο, τα εγγόνια του Μαρία-Ιωάννα, Ζήση, Βασίλη, την αδελφή του Κατερίνα και τους υπόλοιπους συγγενείς.  

Η κηδεία του τελέστηκε το μεσημέρι του Σαββάτου 4 Μαρτίου, στον ιερό ναό Αναστάσεως του Λαζάρου, στο νέο Κοιμητήριο της Χαλκίδας, στο Πέι Δοκού, όπου συγγενείς και φίλοι τον συνόδεψαν στην τελευταία του κατοικία.