Σε ηλικία 87 ετών, άφησε την τελευταία του πνοή ο Θεόφιλος Μποτζακάκης. Ο θάνατός του προκάλεσε θλίψη στη σύζυγό του Ευαγγελία, στα παιδιά του Γιάννη και Σωτηρία, Δημήτρη, στην εγγονή του, στον αδελφό του και στους υπόλοιπους συγγενείς. 

Η κηδεία του τελέστηκε το πρωί της Παρασκευής 24 Ιανουαρίου, στον ιερό ναό Αναστάσεως του Λαζάρου, στο νέο Κοιμητήριο της Χαλκίδας, όπου συγγενείς και φίλοι τον συνόδεψαν στην τελευταία του κατοικία.