Σύμφωνα με το «Πόρισμα της Ειδικής Επιτροπής Επεξεργασίας και Τελικού Σχολιασμού του Σχεδίου Ενοποιήσεων των Δημόσιων Οικονομικών Υπηρεσιών (ΔΟΥ)» του Υπουργείου Οικονομικών, η ΔΟΥ Θηβών παραμένει σε λειτουργία.
Όπως αναφέρεται στο Δελτίο Τύπου του Υπουργείου Οικονομικών η επιλογή των ΔΟΥ που παραμένουν εν λειτουργία έγινε αυστηρά βασιζόμενη σε οικονομικά και διοικητικά κριτήρια, με βάση τα έσοδά τους.