Ο Μιχαλολιάκος κατηγορείται για ένταξη και διεύθυνση εγκληματικής οργάνωσης και οι ανακριτές μαζί με τους εισαγγελείς που θα αποφάσιζαν για την προφυλάκισή του, ήθελαν να έχουν πρώτα την εκδοχή του πυρηνάρχη Γιώργου Πατέλη.
Μετά την απολογία Πατέλη, αποφάσισαν να κριθούν και οι δύό προφυλακιστέοι, ενώ ο Μιχαλολιάκος φέρεται να υποστήριξε μεταξύ άλλων ότι η δίωξή του είναι πολιτική.